實(shí)驗(yàn)室為了進(jìn)行檢驗(yàn)質(zhì)量控制、檢驗(yàn)方法的驗(yàn)證、確認(rèn)滅菌效果、培養(yǎng)基或其他生物試劑性能確認(rèn)等方面的工作，都需要用到一定量的標(biāo)準(zhǔn)菌株。按照中國實(shí)驗(yàn)室國家認(rèn)可委員會指定的檢測和校準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可準(zhǔn)則(CNAL/AC01)中關(guān)于標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的規(guī)定，微生物標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)應(yīng)嚴(yán)格其保存、使用、管理及確認(rèn)程序。微生物標(biāo)準(zhǔn)菌株的保存、使用和管理是食品微生物實(shí)驗(yàn)室的一項(xiàng)重要工作。
獲取
實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)菌株可以通過購買、交換、接受贈送等途徑獲得。實(shí)驗(yàn)室自行分離的菌株對圖標(biāo)準(zhǔn)菌株經(jīng)過鑒定后，可以做為參考菌株(參考培養(yǎng)物， reference cultures)在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)使用。
標(biāo)準(zhǔn)菌株的源頭是專門的菌種保藏機(jī)構(gòu)的菌株，如ATCC (American Type Culture Collection美國典型培養(yǎng)物保藏中心)的菌株、其他國外權(quán)威菌種保藏機(jī)構(gòu)或我國國家菌種庫儲存的各級標(biāo)準(zhǔn)菌株等。
需要注意，商業(yè)來源的菌株是演化菌株(派生菌株),并不是原代菌株，例如：商業(yè)ATCC菌株都是派生菌株。保藏中心提供的菌都有固定的編號（菌株號)。
通常菌株編號由兩部分組成：前面是幾個字母的縮寫代表菌種保藏機(jī)構(gòu)，后面緊跟一串?dāng)?shù)字表明其編號。
活化
從菌種保藏中心購買的菌種一般是安瓿瓶裝的凍干粉劑，近來又出現(xiàn)了幾種新的菌種保藏方式，如： MAST CRYOBANK菌種保藏管、LyfoCults Plus菌種保藏系統(tǒng)、Culti -Loops菌種保藏系統(tǒng)等。
參照隨附的菌種使用活化方法進(jìn)行活化。商品化的保藏菌株須按照廠商的說明進(jìn)行，對于有特殊條件要求的菌株尤其要按照推薦的方法執(zhí)行。
根據(jù)GB 19489 《實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求規(guī)定》，病原微生物分為I級~N級危害等級。實(shí)驗(yàn)室在符合相應(yīng)生物安全水平的條件下，進(jìn)行菌種活化，一定要做好防護(hù)。食品微生物實(shí)驗(yàn)室一般只需儲存危害等級I、II級的微生物，高危害等級的微生物不應(yīng)在食品微生物實(shí)驗(yàn)室保存。
(一)外包裝的開啟
從保藏中心購買的菌株通常有三層包裝。內(nèi)層(如安瓿瓶)是用于盛放微生物，完全密閉，外面用吸水材料包裹，泄漏時起吸附作用。中間層是用塑料罐、泡沫塑料等制成的，對內(nèi)層起支撐保護(hù)作用，該層可以裝數(shù)個內(nèi)層容器，兩者之間有填充填料。外層是硬紙板箱、木箱、塑料箱等制成的，用于保護(hù)內(nèi)包裝。
包裝開啟先要根據(jù)菌種所需的防護(hù)水平，穿防護(hù)服，帶好手套、口罩、帽子，然后檢查菌種包裝外觀，仔細(xì)看有無滲漏、破損等異常現(xiàn)象。檢查無異常后將外包裝除去，依次檢查中間層、內(nèi)層，直至完全打開。
若發(fā)現(xiàn)內(nèi)外層包裝都有破損滲漏現(xiàn)象，并且安瓿瓶等微生物容器已經(jīng)破損，要立刻通知有關(guān)部門和菌種發(fā)放單位，對包裝、運(yùn)輸工具等微生物污染物進(jìn)行消毒。若外包裝有破損等異常情況，但安瓿瓶等微生物容器無破損，或安瓿瓶等微生物容器已破損，但外包裝無破損、滲漏情況，則無需溯源。對安瓿瓶等微生物容器無破損，按要求開啟；對安瓿瓶等微生物容器已破損，可按照生物安全操作原則，對微生物污染物進(jìn)行消毒滅菌處理。
(二)安瓶瓶的開啟及菌種復(fù)活
檢查完好無損的安瓶瓶可以開啟，一般按下面方法打開內(nèi)層包裝，取菌種。
單瓶安瓶瓶(見圖1),先用75%酒精棉擦拭安瓶瓶上部，再用砂輪在安瓿瓶上部橫向銼一道痕跡，然后將劃痕處向外，用無菌脫脂棉包住安瓿瓶(保護(hù)雙手),手持安瓿瓶從銼痕處稍向外用力打開安瓶瓶。還可采用將安瓿管頂部燒熱，滴上幾滴無菌冷水或用無菌棉簽沾冷水在頂部擦一擦，頂部出現(xiàn)裂紋，用消毒鑷子輕叩一下，敲下安瓿管的頂端。
雙瓶安剖瓶（見圖2）先把外瓶的頂端燒熱，再在頂端滴幾滴冷水，使頂端玻璃出現(xiàn)裂紋，用鑷子等敲掉頂端，最后用消毒鑷子取出絕緣層和閃瓶。
選擇合適的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件(根據(jù)生產(chǎn)商說明)進(jìn)行復(fù)活。凍干菌株的傳代次數(shù)不得超過5代，從菌種保藏中心購買的凍干菌種為第0代。
細(xì)菌的復(fù)活方法：用無菌吸管(或移液器)吸0.5 mL液體培養(yǎng)基加到凍干菌塊上，吹打制成菌懸液。將全部菌懸液移入5ml合適的肉湯培養(yǎng)基中。將管中殘留的幾滴懸液移種到斜面上。在合適的條件下培養(yǎng)，細(xì)菌培養(yǎng)溫度通常為25℃或37℃。多數(shù)凍干菌株會在幾天后長出，但是少數(shù)菌會表現(xiàn)出延滯期延長的現(xiàn)象，需要將正常培養(yǎng)時間加倍。
霉菌和酵母菌的復(fù)活方法：用無菌吸管(或移液器)吸0.5 ml-1 ml無菌水到凍干菌塊上，將全部內(nèi)容物移入裝有5mL無菌水的試管中進(jìn)行復(fù)水，2h (或過夜)后接種到肉湯或固體瓊脂上，在合適的溫度下培養(yǎng)，真菌培養(yǎng)溫度通常是25℃。少數(shù)培養(yǎng)物會表現(xiàn)出延滯期延長的現(xiàn)象，需要將正常培養(yǎng)時間加倍。如菌株在推薦的條件下培養(yǎng)不生長，須滅菌處理之后方可丟棄。
(三) MAST CRYOBANK菌種保藏管的使用
MAST CRYOBANK菌種保藏管是由冰凍小管組成的多功能保藏系統(tǒng)，每支小管中包含20-25粒覆有特殊低溫防腐溶液且經(jīng)過化學(xué)處理的珠子。菌種保藏時，只需將經(jīng)純化培養(yǎng)培養(yǎng)生長旺盛的菌株接入保藏管溶液中，通常需要4~7環(huán)，苛養(yǎng)菌要多接一些，擰緊蓋子充分震蕩，細(xì)菌即吸附在小珠子上，再用無菌吸管吸走溶液，放入冰箱保藏， -70℃可保存10年，-15 ℃~-10℃可保存1年~3年。
菌種的活化只需將小珠放在合適的瓊脂平板上滾動或置于肉湯中培養(yǎng)即可。
(四) LyfoCcults Plus菌種保藏系統(tǒng)
LyfoCcults Plus菌種保藏系統(tǒng)是一個集儲存、復(fù)溶和接種于一體的系統(tǒng)。形狀像鋼筆，使用方便。使用時只需撕開鋁箔袋，取出LyfoCults Plus裝置，旋開一端，取出接種棒，用力擠捏另一端的塑料安剖瓶的液體，混勻后流入帶干粉狀菌小管中，用接種棒在小管中攪動，使菌復(fù)溶形成菌懸液，用接種棒蘸兩滴菌液接種到培養(yǎng)基上，涂抹均勻后進(jìn)行培養(yǎng)復(fù)蘇。
LyfoCults Plus菌種保藏系統(tǒng)的使用見圖3。
(1)從箔片包裝上揭下預(yù)先打印好的標(biāo)簽，貼在要接種的培養(yǎng)基上。
(3)撕開安全密封條。
(4)旋開小管上的敷抹器，打開系統(tǒng)。
(5)用力擠壓安瓿瓶，使所有的液體化合物倒進(jìn)小管中。
(6)混勻。
(7)把小管的頂部作為移液管，在培養(yǎng)基上滴兩滴菌懸液。
(8)用小管的尖端在培養(yǎng)基上劃線。
L,yfoCults Plus菌種保藏系統(tǒng)的使用
(五) Culti-Loops菌種保藏系統(tǒng)
Culti-Loops菌種保藏系統(tǒng)是一種接種環(huán)形式的菌種保藏系統(tǒng)，接種環(huán)上有少量的菌，無需制備，可直接在平板上劃線進(jìn)行活化，每個接種環(huán)可接5塊平板。此保藏系統(tǒng)除彎曲菌需冷凍保存（-18℃）外，其他只需2℃~8℃保存。
(六)實(shí)驗(yàn)室其他方法保藏菌株的復(fù)活
實(shí)驗(yàn)室內(nèi)采用其他方法保藏的菌種復(fù)活時可按不同的方法。如在超低溫冰箱中的菌種，復(fù)活時，只需取出冷凍菌種的小管，在室溫下融化后接種在適宜的培養(yǎng)基中培養(yǎng)即可。液體石蠟法、沙土管保藏法、半固體穿刺保藏法保藏的，用接種環(huán)挑取即可。
確認(rèn)
菌種確認(rèn)可從菌落形態(tài)，細(xì)胞形態(tài)，芽孢大小、位置、形狀，生化鑒定等方面進(jìn)行。
(一)菌落形態(tài)
取復(fù)活后的菌，在相應(yīng)的鑒別平板或普通非選擇性平板上劃線分離，培養(yǎng)出單菌落，觀察菌落形態(tài)是否符合，同一平板上的單菌落的大小、形狀、顏色、質(zhì)地、光澤等是否相似；對于出現(xiàn)兩種或以上形態(tài)的菌株，應(yīng)再分別挑取單菌落劃線或稀釋涂布培養(yǎng)，檢測是否重復(fù)出現(xiàn)相同特征。
(二)細(xì)胞形態(tài)
對數(shù)生長期的培養(yǎng)物革蘭氏等染色反應(yīng)應(yīng)呈現(xiàn)一致性，細(xì)胞形狀、大小、鞭毛、莢膜等特征應(yīng)相似。
(三)芽孢
形成芽孢的菌種，其芽孢大小、位置、形狀應(yīng)相似。
(四)生化鑒定
必要時進(jìn)行生化鑒定等實(shí)驗(yàn)，進(jìn)一步確認(rèn)。
在菌種確認(rèn)過程中，如發(fā)現(xiàn)菌種有污染，則要分離挑選目標(biāo)菌株，培養(yǎng)成功后將污染培養(yǎng)物高壓滅菌處理。
